Spätzle nach Packungsangabe kochen, abgießen, abtropfen lassen und in die gefettete Auflaufform geben.
Butter im Topf erhitzen. Mehl darin anschwitzen und mit Brühe und Milch ablöschen. Unter Rühren 5 min. köcheln. Käse einrühren und mit Salz, Pfeffer und Muskat abschmecken.
Kasseler würfeln, Zwiebel in halbe Ringe schneiden. Zwiebeln im Schmalz goldbraun anbraten. Kasseler, Sauerkraut, Wacholder, Kümmel und Lorbeerblatt dazugeben und etwa 5 min. mitdünsten.
Alles mit der Soße zu den Spätzle geben und vermischen. Mit Emmentaler bestreuen und im vorgeheizten Backofen bei 200° 40 min. backen. In der Form servieren.